Las escuelas charter reciben financiación pública pero son de gestión independiente, y muchas admiten a los alumnos por sorteo. Su calidad, sus programas y sus resultados varían mucho, por lo que conviene leer el informe de cada escuela y hablar con otros padres antes de presentar la solicitud.
Brooklyn tiene una larga tradición de escuelas independientes, entre ellas Packer Collegiate Institute, Poly Prep, Saint Ann’s School, Berkeley Carroll y Brooklyn Friends, así como una amplia red de escuelas católicas y de escuelas diurnas y yeshivas judías. Las matrículas, las becas y los requisitos de admisión varían, y muchas escuelas organizan jornadas de puertas abiertas en otoño.
Las organizaciones comunitarias y los proveedores de actividades extraescolares también ofrecen programas de idiomas, artes e intereses especiales, a menudo a menor costo, y muchas bibliotecas públicas ofrecen ayuda con los deberes y talleres gratuitos.