Les ferries, puis le pont de Brooklyn, ouvert en 1883, ont relié Brooklyn à Manhattan. En 1898, la ville indépendante de Brooklyn est entrée dans la nouvelle ville de New York unifiée, comme l’un de ses cinq arrondissements.
Le Brooklyn Bridge, conçu par John A. Roebling et achevé sous la direction de son fils Washington Roebling et d’Emily Warren Roebling, a demandé quatorze ans de travaux et était le plus long pont suspendu du monde à son ouverture. Il a rendu possible l’essor de Brooklyn en grande ville, et le Manhattan Bridge (1909) et le Williamsburg Bridge (1903) ont rapidement suivi.
Brooklyn est devenue une ville industrielle et portuaire, avec le raffinage du sucre, la construction navale au Navy Yard, des brasseries, des usines et les quais très actifs de Red Hook et de Sunset Park. La fusion de 1898 n’a été adoptée à Brooklyn que d’extrême justesse, et beaucoup d’habitants ont encore le sentiment d’y avoir perdu quelque chose, un état d’esprit qui perdure dans la fierté locale farouche de l’arrondissement.